Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sbf2E9PXF8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbf2E9PXF8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms