Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms