Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ccdc8D3YZV8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms