Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf217D3YYI7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms