Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim30cD3YVI9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms