Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms