Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms