Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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