Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms