Protein–RNA interactions for Protein: B2RUD9

Gm4787, MCG140564, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4787B2RUD9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4787B2RUD9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms