Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tnfrsf25B1AWN9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tnfrsf25B1AWN9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tnfrsf25B1AWN9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tnfrsf25B1AWN9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf25B1AWN9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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