Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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