Protein–RNA interactions for Protein: A7XV07

Skint8, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint8A7XV07 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Skint8A7XV07 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Skint8A7XV07 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skint8A7XV07 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skint8A7XV07 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skint8A7XV07 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms