Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11127A7VMS2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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Gm11127A7VMS2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gm11127A7VMS2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gm11127A7VMS2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gm11127A7VMS2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gm11127A7VMS2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gm11127A7VMS2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gm11127A7VMS2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm11127A7VMS2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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