Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skint4A7TZF3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms