Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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PtprfA2A8L5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PtprfA2A8L5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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PtprfA2A8L5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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PtprfA2A8L5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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PtprfA2A8L5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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PtprfA2A8L5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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PtprfA2A8L5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprfA2A8L5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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