Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms