Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JEU3

Trdc, T cell receptor delta, constant region (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdcA0A0G2JEU3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrdcA0A0G2JEU3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrdcA0A0G2JEU3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms