Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2210011C24RikA0A087WQ89 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms