Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm5538W4VSP6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm5538W4VSP6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm5538W4VSP6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm5538W4VSP6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5538W4VSP6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm5538W4VSP6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm5538W4VSP6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm5538W4VSP6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm5538W4VSP6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm5538W4VSP6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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