Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r25W4VSP2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms