Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms