Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gria3Q9Z2W9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms