Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac5Q9Z2V6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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