Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms