Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx39bQ9Z1N5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms