Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Cldn9Q9Z0S7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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