Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1bQ9WU38 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scnn1bQ9WU38 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms