Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CHORDC1Q9UHD1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms