Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms