Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Psma1Q9R1P4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms