Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
AmfrQ9R049 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AmfrQ9R049 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms