Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Col4a4Q9QZR9 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Col4a4Q9QZR9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Col4a4Q9QZR9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Col4a4Q9QZR9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Col4a4Q9QZR9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Col4a4Q9QZR9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Col4a4Q9QZR9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Col4a4Q9QZR9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Col4a4Q9QZR9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Col4a4Q9QZR9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Col4a4Q9QZR9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Col4a4Q9QZR9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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