Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms