Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms