Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK7

Rnf11, RING finger protein 11, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf11Q9QYK7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf11Q9QYK7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf11Q9QYK7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf11Q9QYK7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf11Q9QYK7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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