Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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