Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms