Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col5a3Q9JLI2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Col5a3Q9JLI2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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