Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr5Q9JLF7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr5Q9JLF7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr5Q9JLF7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr5Q9JLF7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr5Q9JLF7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr5Q9JLF7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr5Q9JLF7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr5Q9JLF7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr5Q9JLF7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr5Q9JLF7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr5Q9JLF7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr5Q9JLF7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr5Q9JLF7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr5Q9JLF7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr5Q9JLF7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr5Q9JLF7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr5Q9JLF7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr5Q9JLF7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr5Q9JLF7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr5Q9JLF7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr5Q9JLF7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr5Q9JLF7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr5Q9JLF7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr5Q9JLF7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlr5Q9JLF7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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