Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Hmgn5Q9JL35 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Hmgn5Q9JL35 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Hmgn5Q9JL35 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Hmgn5Q9JL35 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Hmgn5Q9JL35 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmgn5Q9JL35 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms