Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace2Q9JL18 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms