Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ap3m1Q9JKC8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms