Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Uchl3Q9JKB1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Uchl3Q9JKB1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Uchl3Q9JKB1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Uchl3Q9JKB1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Uchl3Q9JKB1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms