Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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