Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scube2Q9JJS0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms