Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms