Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lima1Q9ERG0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lima1Q9ERG0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lima1Q9ERG0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lima1Q9ERG0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lima1Q9ERG0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lima1Q9ERG0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lima1Q9ERG0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lima1Q9ERG0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lima1Q9ERG0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lima1Q9ERG0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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