Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clstn2Q9ER65 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms