Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnft1Q9DCN7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnft1Q9DCN7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rnft1Q9DCN7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rnft1Q9DCN7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnft1Q9DCN7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rnft1Q9DCN7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnft1Q9DCN7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnft1Q9DCN7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnft1Q9DCN7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnft1Q9DCN7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rnft1Q9DCN7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rnft1Q9DCN7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnft1Q9DCN7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnft1Q9DCN7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rnft1Q9DCN7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rnft1Q9DCN7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rnft1Q9DCN7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnft1Q9DCN7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnft1Q9DCN7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnft1Q9DCN7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnft1Q9DCN7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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